Die räumliche Ausdehnung der AMD von einem Hauptsitz in Hamburg aus über Studienzentren in Berlin, München und Düsseldorf bringt eine Aufgabenverteilung in zentrale und dezentrale Arbeiten mit sich.
Ein übergeordnetes Kuratorium von ausgewählten Persönlichkeiten aus den Bereichen Kunst, Wissenschaft, Forschung und Wirtschaft wird die Hochschule in der Erfüllung ihrer Aufgaben beraten und unterstützten.
Das Präsidium der AMD ist in Hamburg angesiedelt. Unter Leitung der Präsidentin werden von hier aus allgemeine Hochschulangelegenheiten zentral geregelt. Im Auftrag der Kanzlerin betreuen AkademieleiterInnen am Hauptsitz und an den Studienzentren die Hochschulverwaltung und das Personalwesen.
Mit dem Hochschulsenat und den Fachbereichsräten verfügt die AMD über zentrale Organe der Selbstverwaltung, die mit VertreterInnen der einzelnen Standorte besetzt sind und für die gesamte Institution entscheiden. Sie bestimmen mit über Lehre und Profil der Hochschule und sichern ihre Autonomie. Der Allgemeinen Studierendenausschuss (AStA) ist dezentral verankert, schickt jedoch seine VertreterInnen ebenfalls in die zentralen Selbstverwaltungsorgane und partizipiert so an der Selbstverwaltung der Hochschule.
Ein zentrales Prüfungsamt koordiniert die Abläufe an den dezentral angesiedelten Außenstellen.
Die Lehre und die Betreuung der Studierenden werden in den einzelnen Studienzentren in Düsseldorf, München und Berlin und im Hauptsitz in Hamburg nach einheitlichen Richtlinien dezentral durchgeführt. Studierendenservice, Studienkoordination und Dependancen des zentralen Prüfungsamts betreuen vor Ort die Studierenden in allen Angelegenheiten von der Bewerbung bis zum Erhalt der Zeugnisse.
Beratung findet dezentral auf den Infoabenden und in Einzelgesprächen mit den ProfessorInnen und den StudiendekanInnen in den Studienzentren statt. Fachberatung in Verbindung mit den Berufspraktika ermöglicht hier den Studierenden die individuell angepasste Ausrichtung ihres Studiums.